JCLA：代谢途径相关lncRNA在人类胃癌中的表达谱，以及RP11‐555H23.1作为新的诊断生物标志物的鉴定
2019-07-12 Gladiator MedSci原创
研究表明，长链非编码RNA (lncRNA)具有调节代谢的作用；然而，代谢途径‐相关lncRNA在胃癌中的表达谱尚不清楚。本研究的目的是研究代谢途径相关lncRNA在胃癌中的作用及其可能的诊断价值。 利用代谢通路相关lncRNA芯片检测胃癌和配对非肿瘤组织中代谢通路相关lncRNA的差异表达模式。RP11‐555H23.1是一种具有代表性的代谢通路‐相关lncRNA，通过定量实时逆转录‐聚合
研究表明，长链非编码RNA (lncRNA)具有调节代谢的作用；然而，代谢途径‐相关lncRNA在胃癌中的表达谱尚不清楚。本研究的目的是研究代谢途径相关lncRNA在胃癌中的作用及其可能的诊断价值。
利用代谢通路相关lncRNA芯片检测胃癌和配对非肿瘤组织中代谢通路相关lncRNA的差异表达模式。RP11‐555H23.1是一种具有代表性的代谢通路‐相关lncRNA，通过定量实时逆转录‐聚合酶链反应(qRT‐PCR)验证了其表达。分析RP11‐55H23.1表达与胃癌患者临床病理特征的关系。进一步建立了接收者工作特性曲线。
在肿瘤组织和非肿瘤组织中共发现114个差异表达的代谢通路‐相关lncRNA(>2的倍数变化，P < 0.05) (GEO No。GSE96856)。其中TUG1、RP11‐555H23.1、RP1‐257I20.13、UGP2、GCSHP3和XLOC_000889 lncRNA在胃癌组织中下调超过6倍。相比之下，胃癌组织中RP11‐605F14.2、TBC1D3P5、BC130595、LINC00475、RP11‐19P22.6、BC080653、XLOC_004923、AFAP1‐AS1、EPB49和RP11‐296I10.3 lncrna的上调幅度超过6倍。我们进一步证明RP11‐555H23.1表达与TNM分期显著相关(P = 0.038)。ROC曲线下面积(AUC)为0.65，特异性和敏感性分别为62%和81%。
代谢通路相关lncrRNA在胃癌的发生过程中发挥着重要作用，而代谢通路相关lncRNA，如RP11‐555H23.1，可能是胃癌新的生物标志物。
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