Eur Urol Focus：晚期透明细胞肾细胞癌中免疫细胞浸润模式与体细胞变异的关系
2021-06-09 AlexYang MedSci原创
免疫检查点抑制剂（ICIs），如nivolumab、ipilimumab、avelumab和pembrolizumab，已经证明可以延长转移性透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的生存期。在所有的肿瘤类
免疫检查点抑制剂（ICIs），如nivolumab、ipilimumab、avelumab和pembrolizumab，已经证明可以延长转移性透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的生存期。在所有的肿瘤类型中，对ICI的反应与较高的体细胞突变频率相关。人们认为这些突变产生了肿瘤特异性的新抗原，刺激了强烈的抗肿瘤免疫反应。相反，对ccRCC肿瘤的分析表明，其体细胞突变的频率相对较低，但免疫细胞浸润的水平却很高，这表明突变并不是诱发ccRCC免疫浸润的唯一原因。
与其他恶性肿瘤相比，透明细胞肾细胞癌（ccRCC）基因变异频率较低，但免疫细胞浸润水平非常高，对免疫疗法的响应率也较好。目前，特定的ccRCC体细胞突变和免疫浸润模式之间的相互作用还不清楚。
近期，有研究人员分析了常见的ccRCC体细胞突变与肿瘤免疫微环境（TIME）中免疫细胞浸润模式之间的关联。
研究包括了48名IV期ccRCC患者的肿瘤样本（24名为原发性，24名为转移性）。对ccRCC中特征明确的常见体细胞突变进行了靶向测序，分析的重点是六个最常见的突变基因：VHL， BAP1， PBRM1， SETD2， TP53和KDM5C。对于每个样本，研究人员在淋巴和骨髓panels中对三个区域（肿瘤核心、基质和肿瘤-瘤体界面）的七个关注的区域进行了多重免疫荧光（IF）。用线性混合模型分析比较了不同患者的IF细胞密度，并按体细胞突变状态进行了分层。最后使用了来自三个大型外部数据的RNA-seq富集评分进行了外部验证。
结果发现，具有SETD2突变的肿瘤在肿瘤核心、基质和肿瘤-间质界面中，FOXP3+T细胞水平明显下降。PBRM1突变与肿瘤核心中FOXP3+T细胞的减少有关。KDM5C突变与肿瘤核心中增加的CD206+巨噬细胞肿瘤浸润有关。利用RNA-seq数据估计TIME中免疫细胞类型的计算方法-xCell评分，未能在大型外部数据集中验证IF分析的关联。该研究的一个主要限制是所参与的病人群体相对较小。
整个队列肿瘤样本的体细胞变异情况
综上所述，他们的研究提供的证据表明，ccRCC的常见体细胞突变（如SETD2、PBRM1和KDM5C）与TIME中不同的免疫浸润模式有关。
原始出处：
Nicholas H Chakiryan， Ali Hajiran， Youngchul Kim et al. Correlating Immune Cell Infiltration Patterns with Recurrent Somatic Mutations in Advanced Clear Cell Renal Cell Carcinoma. Eur Urol Focus. May 2021
作者：AlexYang
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