基于RNA-Seq的长非编码RNA(lncRNA)预测

2014-01-03 郭晓强,田占涛,李娜,段相林,王越甲 生物化学与生物物理学进展

随着新一代生物技术和生物信息学的发展,研究发现在真核生物转录组中存在大量长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA),而这些lncRNA可能在基因表达调控过程中起到关键性的功能作用. 当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术,并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析,以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功

随着新一代生物技术和生物信息学的发展,研究发现在真核生物转录组中存在大量长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA),而这些lncRNA可能在基因表达调控过程中起到关键性的功能作用. 当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术,并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析,以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功能等信息. 本文将对基于RNA-Seq的lncRNA预测流程进行介绍,对其中涉及的生物信息学方法进行较为全面的综述,就相关问题和挑战展开讨论,并对研究进行展望基于RNA_Seq的长非编码RNA预测_孙磊.pdf

作者:郭晓强,田占涛,李娜,段相林,王越甲



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