Front Microbiol:研究发现参与宫颈癌发生的新的lncRNA和circRNA
2017-10-04 MedSci MedSci原创
宫颈癌是全球第三大常见癌症,也是女性癌症相关死亡率的第四大原因。既往研究表明长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)可能在不同癌症的致癌作用中起关键作用;然而,关于lncRNA和circRNAs在宫颈癌进展和转移中的机制知之甚少。在本研究中,研究人员采用高通量RNA测序研究HPV16(人乳头状瘤病毒基因型16)介导的宫颈鳞状细胞癌和相邻非肿瘤(ATN)组织中的lncRNAs,
宫颈癌是全球第三大常见癌症,也是女性癌症相关死亡率的第四大原因。既往研究表明长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)可能在不同癌症的致癌作用中起关键作用;然而,关于lncRNA和circRNAs在宫颈癌进展和转移中的机制知之甚少。
在本研究中,研究人员采用高通量RNA测序研究HPV16(人乳头状瘤病毒基因型16)介导的宫颈鳞状细胞癌和相邻非肿瘤(ATN)组织中的lncRNAs,circRNAs,miRNAs和mRNA的表达谱(RNA-SEQ)。结果,研究人员在不同的患者中共鉴定了19个lncRNA,99个circRNA,28个miRNA以及304个差异表达(DE)的mRNA。在非编码RNA中,3个lncRNA和44个circRNA是新发现的。
功能富集分析显示,癌症及其他基因本体(GO)关键通路中DE lncRNAs、miRNAs和mRNAs的表达升高。此外,共表达网络和功能预测表明,19种DE lncRNA在子宫颈癌的发生和发展中均起到了不同的作用。基于DE编码和非编码RNAs的竞争性内源性RNA(ceRNA)网络显示,每个miRNA靶向了许多lncRNA和circRNA。网络中部分miRNA和子宫颈癌之间的联系已经在以前的研究中得到验证,这些miRNA靶向了大多数新型非编码RNA,因此表明这些新型非编码RNA可能参与了宫颈癌的发生及发展。
总而言之,该研究表明,DE非编码RNA可作为宫颈癌的诊断和治疗生物标志物。复杂的ceRNA网络也为今后对子宫颈癌编码和非编码RNAs作用的研究奠定了基础。
原始出处:
Hongbo Wang, Yingchao Zhao, Mingyue Chen, Jie Cui. Identification of Novel Long Non-coding and Circular RNAs in Human Papillomavirus-Mediated Cervical Cancer. Front Microbiol. 2017; 8: 1720. Published online 2017 Sep 19. doi: 10.3389/fmicb.2017.01720
作者:MedSci
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