Nat Commun:研究揭示炎症促进癌细胞转录组改变的机制

2017-10-11 MedSci MedSci原创

炎症影响癌症发生,进展和治疗效果,但免疫信号传导驱动癌细胞转录组改变的机制目前仍不清楚。通过使用ChIP-seq,RNA-seq和GRO-seq分析,研究人员发现在肿瘤促进的p53突变体和主促炎症调节银子NFκB的结合区域存在整体重叠,从而促进慢性TNF-α信号转导中增强子和基因活化的改变。研究人员还发现,发现p53突变体与NFκB直接相互作用,并且这两个因素均影响另一个在不同组活性增强子上的结合

炎症影响癌症发生,进展和治疗效果,但免疫信号传导驱动癌细胞转录组改变的机制目前仍不清楚。

通过使用ChIP-seq,RNA-seq和GRO-seq分析,研究人员发现在肿瘤促进的p53突变体和主促炎症调节银子NFκB的结合区域存在整体重叠,从而促进慢性TNF-α信号转导中增强子和基因活化的改变。

研究人员还发现,发现p53突变体与NFκB直接相互作用,并且这两个因素均影响另一个在不同组活性增强子上的结合。反过来,需要这些因子同时和协同结合来调节RNAPII的募集,增强子RNA的合成以及促肿瘤基因的激活。

总的来说,这些发现建立了慢性TNFα信号编排突变型p53和NF-κB之间的功能性相互作用并引起促癌基因表达改变的机制。

原始出处:


Homa Rahnamoun, Hanbin Lu,et al., Mutant p53 shapes the enhancer landscape of cancer cells in response to chronic immune signaling. Nat Commun. 2017; 8: 754.
Published online 2017 Sep 29. doi:  10.1038/s41467-017-01117-y

作者:MedSci



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