Nature microbiology:武汉疾控中心重查流感拭子:9例实为新冠样本,1月初病毒已在社区传播

2020-04-09 生物探索 生物探索

早在1月初,武汉及其周边地区已经存在SARS-CoV-2社区传播。

4月8日,因新冠疫情封锁已久的武汉开始“解冻”。不过,关于新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的诸多谜团仍未得到解答,比如,它是何时出现的,又是什么时候开始在人群中传播的。

当地时间4月7日,《Nature microbiology》发布的一项回顾性研究为研究人员还原新冠肺炎(COVID-19)疫情的流行轨迹提供了一些重要信息。

这项由武汉市疾控中心与美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校的研究人员联合带来的研究报告显示,早在1月初,武汉及其周边地区已经存在SARS-CoV-2社区传播。

https://doi.org/10.1038/s41564-020-0713-1

自2005年以来,武汉市在全国流感监测网的基础上,开始对流感样病例及其病因进行持续哨点监测。为了更好地了解武汉市的疫情,研究人员重新分析了2019年10月6日至2020年1月21日期间,武汉市儿童医院以及武汉市第一医院从640位流感样疾病患者身上采集到的咽拭子样本,其中315人为男性患者,325人为女性患者,年龄区间在9个月至87岁之间,平均年龄为22.7岁。

由于当时恰好是流感及其他呼吸道疾病发作的高峰期,因此从12月初开始,所有年龄段的流感样病例数均急剧增加,并且5-14岁组的患病人数增加了24倍。与往年相比,2019-2020年冬季的流感样病例数据要高得多,这说明非常有必要区分流感样病例和疑似COVID-19患者。

在640名患者的咽拭子样本中,研究人员从9名患者的样本检测到了SARS-CoV-2 RNA,他们均为35-71岁的成年人,5人为男性,4人为女性。从时间上来看,这些样本都是在2020年1月份收集的,患者最早发病日期可追溯到1月4日,从发病到求医时间间隔为1.7天,比之前关于确诊病例的报告要短。

同时,COVID-19检出率越来越高。在最后一周,30岁以上的患者中SARS-CoV-2阳性率远高于流感病毒检出率。尽管当时流感仍然肆虐,但是研究人员并未从640例样本中检测到合并感染。

值得注意的是,这9名检测到了SARS-CoV-2 RNA的患者分别来自武汉市区和周边地区的6个不同地区,这为武汉市的社区传播提供了额外证据。

尽管目前存在一些关于新冠病毒定量PCR检测的可靠性和上呼吸道样本(包括咽喉拭子)适用性的争议,但是研究人员认为,这并不会削弱关于1月份在流感样病例中出现SARS-CoV-2的结论。

总体而言,这项研究增加了人们对当前流行病早期阶段的了解,表明早在1月初疫情已经开始出现社区传播。同时,研究人员建议,所有面临SARS-CoV-2社区传播风险的地区,都应加强对流感样病例的病原体监测。

原始出处:

Kong, W., Li, Y., Peng, M. et al. SARS-CoV-2 detection in patients with influenza-like illness. Nat Microbiol (2020). https://doi.org/10.1038/s41564-020-0713-1.



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