International J ofInfectious D: 瑞金医院等团队基于数据驱动分析估计钻石公主号游轮上COVID-19的基本繁殖数和暴发规模
2020-03-23 公共卫生学术热点追踪 公共卫生学术热点追踪
上海交通大学医学院附属瑞金医院、浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院、海军军医大学(第二军医大学)
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2月22日,《International Journal ofInfectious Diseases》上发表了瑞金医院等团队的题为“Estimationof the reproductive number of Novel Coronavirus (COVID-19) and the probableoutbreak size on the Diamond Princess cruise ship: A data-driven analysis”的文章。截至2020年2月16日,钻石公主号游轮上已有COVID-19确诊病例355例,文章基于数据驱动分析,估计了钻石公主号上的COVID-19基本繁殖数(R0)和可能的暴发规模。
文章将报告的序列间隔(平均值和标准差)拟合为伽马分布,并应用R语言中的“earlyR”包估计COVID-19暴发早期的R0。在假设日发病率服从由日决定的近似泊松分布的基础上,利用R“预测”包,将现有日发病率、序列间隔分布和估计的R0拟合到一个模型中,模拟了钻石公主号上的累积流行轨迹和未来的日发病率。
分析结果表明,钻石公主号上COVID-19早期暴发的R0最大似然值(ML)为2.28。用bootstrap重采样法估计的R0值的95%置信区间的中位数为2.28(2.06-2.52)。未来10天新增病例数可能将逐步增加,预计未来10天累计病例将达到1514例(1384-1656)。然而,如果R0值降低25%和50%,估计的累计病例总数将分别减少到1081例(981-1177)和758例(697-817)。因此,未来的日发病率和可能的暴发规模在很大程度上取决于R0的变化。文章分析结果表明,除非采取严格的管理和控制措施,否则COVID-19有可能在船上引起更大的疫情暴发。
原始出处:
ShengZhang,et al. Estimation of the reproductive number of novel coronavirus (COVID-19) and the probable outbreak size on the Diamond Princess cruise ship: A data-driven analysis. International Journal ofInfectious Diseases. Volume 93, April 2020, Pages 201-204
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