Nat Genet：DNA遗传与胶质母细胞瘤动态疾病进展
2018-04-26 海北 MedSci原创
研究人员的分析表明，在GBM进化期间，染色体外元件允许基因组异质性的快速增加，而不依赖于染色体DNA改变。
为了了解胶质母细胞瘤（GBM）的基因组异质性是如何导致治疗反应差的，来自美国和韩国的研究人员对GBM样品，以及由它们衍生的神经球和原位异种移植物模型进行了DNA和RNA测序。
研究人员使用得到的数据集，发现了在肿瘤和模型中，体细胞驱动改变占主要部分，包括单核苷酸变体，局部DNA改变，和染色体外DNA（ecDNA）元件上的癌基因扩增。
在一些情况下，在细胞培养和异种移植期间，ecDNA和染色体改变显示出不同的遗传模式和克隆选择动力学。研究人员推断，ecDNA不均匀地被后代细胞遗传，这是一种影响具有更多或更少ecDNA的细胞的致癌潜能的特征。纵向患者肿瘤分析发现，致癌ecDNA在整个疾病过程中经常被保留。
因此，研究人员的分析表明，在GBM进化期间，染色体外元件允许基因组异质性的快速增加，而不依赖于染色体DNA改变。
原始出处：
deCarvalho AC et al. Discordant inheritance of chromosomal and extrachromosomal DNA elements contributes to dynamic disease evolution in glioblastoma. Nature Genetics, 2018; DOI: 10.1038/s41588-018-0105-0
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作者：海北
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