Oncotarget：孔庆鹏课题组发现肿瘤钙信号通路受高甲基化调控
2017-04-21 叶瑞优 昆明动物研究所
DNA甲基化严密调控着基因的表达，在肿瘤发生发展过程中发挥着重要作用。肿瘤抑制基因启动子区往往发生DNA高甲基化，而癌基因启动子区则呈现出低甲基化。因此，异常的DNA甲基化通常被作为肿瘤诊断、分类和治疗的重要分子标记。然而，肿瘤是一种高度异质性疾病，尤其是在跨多种肿瘤类型的情况下，肿瘤DNA甲基化对基因表达的调控模式及规律并不十分清楚。中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏课题组通过对TCGA数据库的12
DNA甲基化严密调控着基因的表达，在肿瘤发生发展过程中发挥着重要作用。肿瘤抑制基因启动子区往往发生DNA高甲基化，而癌基因启动子区则呈现出低甲基化。因此，异常的DNA甲基化通常被作为肿瘤诊断、分类和治疗的重要分子标记。然而，肿瘤是一种高度异质性疾病，尤其是在跨多种肿瘤类型的情况下，肿瘤DNA甲基化对基因表达的调控模式及规律并不十分清楚。
中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏课题组通过对TCGA数据库的12种肿瘤的DNA甲基化状态及其相应的基因表达模式进行整合分析后发现，多种肿瘤类型的钙信号通路均发生显着高甲基化，且发生DNA高甲基化的基因恰好位于钙信号通路的关键节点，例如控制胞内钙流量的G蛋白偶联受体、蛋白激酶A等。此外，蛋白互作关系分析发现高甲基化调控的钙信号通路基因多位于交互网络的中心位置，进一步表明这些基因可能是钙信号影响肿瘤生物学行为的核心基因。因此，钙信号通路基因的异常DNA甲基化可能作为肿瘤治疗和抗肿瘤药物开发的一个潜在靶点。
该研究成果发表在Oncotarget上。昆明动物所博士研究生王晓雄为文章的第一作者，研究员孔庆鹏和副研究员何永扞为文章的并列通讯作者。
该项目得到了科技部“973”项目、国家自然科学基金及中科院等研究基金项目的支持。
原始出处：
Wang XX， Xiao FH， Li QG， et al.Large-scale DNA methylation expression analysis across 12 solid cancers reveals hypermethylation in the calcium-signaling pathway.Oncotarget. 2017 Feb 14
作者：叶瑞优
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