Sci Rep:肺癌细胞的癌症组学特征和药物扰动
2019-12-21 xiangting MedSci原创
这项研究生成的多组学概况以及分层策略有助于更合理、更有效的开发抗癌药物。
这项研究为了更好地理解肺癌转录调控和基因表达的破坏,构建了一个肺癌细胞对一系列化合物反应的多组学目录。
研究生成并分析了从23个细胞系获得的3,240个RNA-seq和3,393个ATAC-seq文库,这些细胞系均使用95种带注释化合物进行处理。为了证明创建多组学资源的功能,研究人员尝试确定可以单独或联合诱导指定变化的药物。首先将基础多组学信息集成到共表达模块中。在这些模块中,研究人员确定了一个压力响应模块,该模块可成为一个有前途的药物治疗靶标,作为化合物的新组合可用于调节模块,并确定了癌细胞表型的出现。
这项研究生成的多组学概况以及分层策略有助于更合理、更有效的开发抗癌药物。
原始出处:
Ayako
Suzuki. Characterization of cancer omics and drug perturbations in panels of lung
cancer cells. Sci Rep. 20 December 2019.
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作者:xiangting
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