Nat Commun：1868个临床病例调查，32个样本的全基因组分析，四川大学在胃癌领域取得新进展
2018-07-02 胖胖同学 iNature
2018年6月30号，四川大学胡建昆课题组与许恒课题组、彭勇课题组等人合作在Nature Communications上在线发表了题为“Prognostic significance of frequent CLDN18-ARHGAP26/6 fusion in gastric signet-ring cell cancer”的研究论文。本文报道了对1868例中国胃癌患者进行的系统调查，发现印戒细
2018年6月30号，四川大学胡建昆课题组与许恒课题组、彭勇课题组等人合作在Nature Communications上在线发表了题为“Prognostic significance of frequent CLDN18-ARHGAP26/6 fusion in gastric signet-ring cell cancer”的研究论文。本文报道了对1868例中国胃癌患者进行的系统调查，发现印戒细胞含量与多种临床特征和治疗结果有关。这项研究提供了对SRCC的临床和基因组特征的深入了解，并强调了频繁的CLDN18-ARHGAP 26/6融合在SRCC化疗反应中的重要性。
胃癌是世界上最常见的癌症之一，也是导致癌症死亡的主要原因之一，尤其是在中国。根据Lauren的分类，被分成多种亚型类，如肠型和弥漫型，弥漫性型治疗效果明显差于肠型。为了从分子水平上研究胃癌发生和异质性的分子机制，研究人员通过高通量的基因组筛查和多种驱动基因的改变，对胃癌的综合基因组特征进行了研究。这些改变的基因通常在其他癌症(如TP 53、PIK3CA、Cdh 1、Smad 4)中被发现，或者在胃癌(如RHOA）中相对特异。作为肿瘤基因组图谱(TCGA)项目的一部分，对胃癌患者群中EBV、MSI、GS和CIN四种亚型(EBV、MSI、GS和CIN)分别进行了系统分析，其中包括EB病毒感染亚型(EBV)、微卫星不稳定性(MSI)、基因组稳定性(GS)和染色体不稳定性(CIN)。发现EBV亚型PIK3CA突变率高(80%)，CIN亚型PIK3CA突变率低(3%)，GS 3亚型中以ARID1A、RHOA和Cdh 1突变为主，这在弥漫型胃癌中已得到证实。
胃癌HSRCC关键基因改变的图谱
此外，还观察到CLDN 18和ARHGAP(即ARHGAP 26或ARHGAP 6)之间的结构重排，这种结构重排也是扩散型的，并且与RHOA突变相互排斥。尽管胃癌在流行程度和治疗结果上存在显着的种族差异，但在TCGA研究中，基于种族血统的频繁突变基因没有发现显着性差异。此外，由于缺乏长期跟踪tcga胃癌队列的信息，没有对基因改变与临床特征的关联进行系统调查。
HSRCC的体细胞拷贝数变异和结构变异
印戒细胞癌（SRCC)在胃癌中具有独特的流行病学和致癌特性，但对预后的基因组特征还没有进行系统的研究。本文报道了对1868例中国胃癌患者进行的系统调查，发现印戒细胞含量与多种临床特征和治疗结果有关。因此，研究人员对32对SRC样本进行了全基因组测序，并确定了CLDN 18-ARHGAP 26/6融合频率(25%)。另外797例患者证实，CLDN 18-ARHGAP 26/6融合率与印戒细胞含量、诊断年龄、男女比例和TNM分期有关。重要的是，CLDN 18-ARHGAP 26/6融合患者的生存率较低，且以奥沙利铂/氟匹嘧啶为基础的化疗无效，这与CLDN 18-ARHGAP 26细胞株化疗耐药的事实相一致。总之，这项研究提供了对SRCC的临床和基因组特征的深入了解，并强调了频繁的CLDN18-ARHGAP 26/6融合在SRCC化疗反应中的重要性。
原始出处：
Yang Shu，et al.Prognostic significance of frequent CLDN18-ARHGAP26/6 fusion in gastric signet-ring cell cancer.Nat Commun.30 June 2018
作者：胖胖同学
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